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利用 TCGA 数据库构建男性乳腺癌的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA 网络

目的通过构建男性乳腺癌的竞争性内源 RNA（ceRNA）调控网络，探讨其发病机制。方法从 TCGA 数据库（The Cancer Genome Atlas Database）中下载男性乳腺癌的长链非编码 RNA（lncRNA）、微小 RNA（miRNA）和 mRNA 的表达谱数据，通过 R 软件的 limma 数据包分析男性乳腺癌差异表达的 lncRNA、miRNA 和 mRNA；分析三者之间的靶向调控关系，构建 ceRNA 网络，并用 Cytoscape 软件可视化，并将差异表达基因进行 GO 富集和 KEGG 通路分析。结果男性乳腺癌中差异表达的 lncRNA 为 275 种，差异表达的 miRNA 为 33 种，差异表达的 mRNA 为 1 675 种。本研究成功构建了男性乳腺癌的 lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA 网络后，GO 富集分析显示，差异表达 mRNA 参与细胞增殖的负调控、转录的负调控、细胞蛋白质代谢过程的调控、细胞迁移的调控、转移酶活性的正调控、间充质细胞增殖的正调控等。KEGG 通路分析显示，差异表达 mRNA 参与癌症的途径、白细胞跨内皮迁移、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）和神经营养蛋白信号通路。结论本研究基于 TCGA 数据库成功构建了男性乳腺癌的 ceRNA 网络。